咖啡曾经在1991年到2016年的长达25年的漫长岁月间，一直被世界卫生组织（WHO）旗下权威的国际癌症研究机构（IARC）列入非常难看，甚至引发恐慌的2B类致癌物，即：很可能对人类致癌（Probably Carcinogenic to Humans）（此类致癌物对人类致癌性证据有限，对实验动物致癌性证据并不充分；或对人类致癌性证据不足，对实验动物致癌性证据充分。） 的物质的黑名单中。但是到了2016年，IARC终于为咖啡的名誉平反，将其从2B类致癌物黑名单剔除，原因很简单：致癌证据不足。
因此，喜爱喝咖啡的人根本不需要有任何担忧咖啡本身致癌问题。除非咖啡里白糖和奶油，假奶精（固体氢化植物油），放太多导致肥胖，肥胖和癌症和慢病相关，或者体质上对咖啡因很敏感，抑或是咖啡因超量心动过速等问题。还有温度不要超过65度。
2016年6月15日世界卫生组织旗下专门机构『国际癌症研究所』（IARC）公布将65℃以上烫饮定义为2A类致癌物。在65℃这样的高温之下，无论喝的饮料本身是否健康、都变得致癌，包括热水。中国北大有一项研究追踪了将近50万中国成年人平均时长达9年之久（该领域迄今为止最大规模）后发现，每天吸烟一根以上或者每天饮用酒精15克（也就相当于一杯啤酒程度）的人群如果同时还有饮用热茶或者很热的茶或者热咖啡热水的习惯的话，那么食道癌发生几率最高可增加至5倍。
